實驗室廢棄物有多種分類方法，如按照廢棄物的化學性質(zhì)分類可以分為有機廢棄物和無機廢棄物。其中實險室有機廢棄物是指在實驗活動中產(chǎn)生的喪失原有價值或者雖未喪失利用價值但被拋棄或者放棄的固態(tài)、液態(tài)或者氣態(tài)的有機類物質(zhì)，包含有揮發(fā)性有機物、鹵代烴、多環(huán)芳烴、有機金屬化合物等；無機廢棄物有重金屬以及無機化合物等。

按廢棄物的危害程度來分可以分為一般廢棄物和有害廢棄物。一般廢棄物是指比較常見的、對環(huán)境和人體相對安全的廢棄物，如實驗室中裝試劑及儀器的包裝紙盒、廢紙、廢塑料、玻璃瓶、廢鐵等。一般廢棄物經(jīng)過回收處理后大多可以成為再生產(chǎn)品。有害廢棄物即危險廢棄物，是指具有腐蝕性、毒性、易燃易爆性、 反應(yīng)性或者感染性等一種或者幾種危險特性的廢棄物。我國環(huán)保部公布了《國家危險廢物名錄》，共列舉了498 種危險廢物，這些廢棄物的收集、貯存及處理需要根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)及標準進行。

實驗室廢棄物還可以分為化學性廢棄物、生物性廢棄物和放射性廢棄物?；瘜W性廢棄物是指實驗室中使用或產(chǎn)生的廢棄化學試劑、藥品、樣品、分析殘液及盛裝危險化學品的容器、被危險化學品污染的包裝物和其它列入國家危險廢物名錄或者根據(jù)國家規(guī)定的危險廢物鑒別標準和鑒別方法認定的具有危險特性的廢棄物。生物性廢棄物主要是開展生物性實驗的實驗室產(chǎn)生的，包括實驗過程中使用過或培養(yǎng)產(chǎn)生的動植物的組織或器官、動物尸體、組織液及代謝物、微生物（細菌、真菌和病毒等）、培養(yǎng)甚等，還包括被微化物污染的實驗耗材、實驗垃圾等。這些實驗廢棄物若未經(jīng)嚴格滅茵處理而直接排出，會造成嚴重的生物性污染后果。 放射性廢棄物是指含有放射性核素或被放射性核素污染，其濃度或比活度大于規(guī)定的清潔解控水平，并且預(yù)計不再利用的物質(zhì)，在一些生物實驗室、醫(yī)學實驗室及礦物冶煉方面的實驗室會產(chǎn)生放射性廢棄物。

按照廢棄物狀態(tài)可分為固體廢棄物、廢液及廢氣。實驗室的固體廢物是實驗活動中產(chǎn)生的固態(tài)或半固態(tài)廢棄物質(zhì)，實驗室所產(chǎn)生的固體廢物包括殘留的固體試劑、多余固體試劑、沉淀絮凝反應(yīng)所產(chǎn)生的沉淀殘渣、消耗和破損的實驗用品、殘留的或失效的固體化學試劑以及生活垃圾等；廢液主要有酸堿性廢水、揮發(fā)性有機溶劑、低揮發(fā)性有機溶劑、含鹵素有機溶劑、 含重金屬廢液、含鹽廢液等；廢氣有易揮發(fā)的有機蒸氣、懸浮顆粒、有毒有害氣體。實驗室中廢棄物的種類和排放量與所進行的試驗有關(guān)。